Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms