Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDAP2Q9NXN4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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