Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms