Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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