Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCC2Q9HCC0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms