Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms