Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5DQ9BY66 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5DQ9BY66 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms