Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A3Q9BRY0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms