Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CICQ96RK0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms