Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms