Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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