Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms