Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms