Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMTQ93088 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms