Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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MS4A15Q8N5U1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A15Q8N5U1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms