Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4K4

RPRML, Reprimo-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMLQ8N4K4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMLQ8N4K4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRMLQ8N4K4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms