Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNDC1Q76NI1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms