Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms