Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms