Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL2Q6F5E8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms