Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms