Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms