Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms