Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALFQ53S48 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms