Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EIPR1Q53HC9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms