Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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