Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UPP1Q16831 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms