Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HIST3H3Q16695 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HIST3H3Q16695 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HIST3H3Q16695 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HIST3H3Q16695 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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