Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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