Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms