Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CDSNQ15517 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDSNQ15517 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDSNQ15517 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDSNQ15517 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDSNQ15517 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CDSNQ15517 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CDSNQ15517 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CDSNQ15517 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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