Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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GBX1Q14549 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GBX1Q14549 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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