Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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