Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBFBQ13951 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms