Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRQ13535 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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