Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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