Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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TRAF1Q13077 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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TRAF1Q13077 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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TRAF1Q13077 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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TRAF1Q13077 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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TRAF1Q13077 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF1Q13077 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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