Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms