Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC9Q06265 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms