Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6Q03468 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERCC6Q03468 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms