Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1DQ01668 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms