Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1P60507 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms