Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DAP3P51398 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DAP3P51398 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DAP3P51398 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms