Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA3P32297 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms