Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHC1P29353 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHC1P29353 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms