Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNI3P19429 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms