Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB1P16220 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms