Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms