Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DMDP11532 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DMDP11532 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DMDP11532 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms