Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms